Eukaryootit ovat kaikenlaisia organismeja, joilla on monimutkaisia soluja, jotka sisältävät mitokondrioita, ytimiä ja muita solun osia. Kolme pääasiallista soluryhmää ovat sienet, kasvit ja eläimet. Monet sienet liittyvät kasveihin vain pinnallisella tavalla. Ne saattavat näyttää hieman kasveilta ja niiden soluseinät ovat samanlaisia kuin kasvisolujen seinät, mutta siellä on frenologiapuu, joka osoittaa, kuinka sienet voivat olla läheisemmässä yhteydessä eläimiin kuin kasveihin. Koska eläimet ovat evoluutiohistoriassa lähempänä sieniä kuin kasveja, voidaan sanoa, että sieni on lähempänä "sukua" ihmiselle kuin vihanneksille salaattibaarissa.
Proteiini
Sienten proteiinisekvenssit ovat samankaltaisempia kuin eläimet kuin kasvit. Esimerkiksi solulimam homeproteiini näyttää enemmän eläinproteiinilta kuin kasviproteiinilta. Sienien ribosomien pituus osoittaa aminohapon, joka on samanlainen kuin lihas. Itse asiassa on useita aminohapposekvenssejä, jotka ovat samanlaisia kuin nisäkkäiden raskasketjuiset proteiinit. Yksi näistä aminohapoista on 81 prosenttia identtinen ihmisen aminohapon kanssa.
Klorofylli
Kasviselluloosa on erilainen kuin sieniselluloosa. Röntgensäteellä kasviselluloosa on kiteisempi kuin sieniselluloosa. Sekä sienet että eläimet eivät sisällä kloroblasteja, mikä tarkoittaa, että sienet eivätkä eläimet pysty käsittelemään fotosynteesiä. Klorofylli tekee kasveista vihreitä ja tarjoaa kasvien ravintoa. Sienet sitä vastoin sienet imevät ravintoaineita hajoavasta kasvimateriaalista entsymaattisella prosessilla, ja eläimet nauttivat ruuansa.
Kitiini
Sienet ja eläimet sisältävät molemmat polysakkaridimolekyylin nimeltä kitiini, jota kasvit eivät jaa. Kitiini on monimutkainen hiilihydraatti, jota käytetään rakenneosana. Sienet käyttävät kitiiniä rakenteellisena elementtinä soluseinämissä. Eläimissä kitiini sisältyy hyönteisten ulkokuoreen ja nilviäisten nokkeihin. Kitiini toimii samalla tavalla kuin kasviselluloosa, mutta kitiini on vahvempi. Sienipolysakkaridilla tehdyt tutkimukset osoittivat, että lisäämällä alkalia sisältävää typpeä tuhoivat sienet ja muodostui etikkahappoa. Näitä kemiallisia reaktioita ei tapahtunut kasvipolysakkarideissa.
Sienet eivät ole leviä
Levät ovat yksinkertaisimpia ja alkeellisimpia kasveja. Vuonna 1955 tohtori George W. Martin totesi, että sienet olivat peräisin levistä, jotka olivat menettäneet klorofyllin. Martinin hypoteesissa ei kuitenkaan pidetty sitä, että ilmakehän olosuhteet olisivat saattaneet olla erilaisia elämän alkaessa kuin mitä ne olivat vuonna 1955. Lisäksi Martin ei ottanut huomioon, että typpeä kiinnittävät bakteerit olisivat voineet olla olemassa jo ennen kasvien kehittymistä, joita olisi voinut käyttää ruuan lähteenä sienille. Vuonna 1966 tohtori A.S. Sussman huomautti, että vaikka sienet näyttivät pinnallisesti kuin levät, siellä oli joitain sienten näkökohtia, kuten solun ytimet ja organisaatio, joita ei voitu selittää.
Sterolit
Jotkut biologit ovat maininneet, että eläin- ja sienisterolit ovat erilaisia, joten sienet eivät voi olla samanlaisia kuin eläimet. Eläimet tuottavat kolesterolia, kun taas sienet tuottavat ergosterolia. Tarkemmassa tutkimuksessa sekä sieni- että eläinsterolit sisältävät lanosterolia, kun taas vihreiden kasvien fytosterolit sisältävät sykloartenolia.
Oma luokka?
Ehkä sieniä ei ole johdettu kasveista eikä yksisoluisista eläimistä. Jotkut biologit ovat väittäneet, että sienet ovat fylogeneettisesti erilaisia kaikista muista eukaryooteista. Sienet näyttävät olevan ainutlaatuisia sikäli, että ne yksin vaativat EF-3-nimisen translaation venymiskerroimen. Jotkut proteiiniaktiviteetit ovat välttämättömiä in vivo -siirron pidentymiselle.
